Das NABU-Bodenseezentrum betreut 28 Schutzgebiete im gesamten Landkreis. Im Raum Konstanz gehören dazu beispielsweise das Wollmatinger Ried, die beiden Mainau-Buchten oder das Dingelsdorfer Ried. Die Schutzgebietsbetreuung bedeutet vor allem bei regelmäßigen Gängen durch das Gelände Veränderungen zu beobachten, diese zu dokumentieren und, wenn möglich und erforderlich, auch zu beseitigen.
Veränderungen und Störungen können durch den Menschen entstehen, insbesondere durch Freizeitaktivitäten wie z.B. Begehen, Radfahren, Lagern, oder Feuermachen. Veränderungen können aber auch durch die Natur selbst entstehen, wie z.B. durch das Eindringen invasiver Pflanzen, Wetterereignisse, oder das Klima. Durch Pflanzenzählungen erlangt man Kenntnisse über Veränderungen der Flora und durch Brutvogelkartierungen die des Vogelbestands. Mit dem Entfernen von Neophyten wir deren Verbreitung verhindert – es ist also allerhand zu tun in so einem Schutzgebiet.